Nominujte Českou hlavu!

Nominujte vědce a doktorandy do 24. ročníku soutěže Česká hlava! Mezi laureáty bude rozdělena finanční odměna více než 1,5 milionu korun. Vyhlášené soutěžní kategorie se našeho ústavu úzce dotýkají, oceněna mohou být témata biotechnologická, biologická, medicínská nebo s dopadem na životní prostředí. Nominovat práci může jak její autor, tak i instituce s tím, že k nominaci není třeba souhlasu zaměstnavatele.

Lhůta pro podání nominací je 11. července 2025.

Grantové příležitosti

Aktuálně vyhlášené grantové výzvy + deadline

• MŠMT MOBILITY Česko-Německo 16. 6. 2025 (fakultní deadline 6. 6. 2025)
• MSCA Cofund 24. 6. 2025

• MŠMT Inter-Eureka 6. 7. 2025 (v případě zájmu kontaktovat grants@muni.cz)

• MŠMT Inter-Excellence II (ČR-USA) 9. 7. 2025
• EMBO Postdoctoral Fellowship 11. 7. 2025
• TAČR Prostředí pro život 2 23. 7. 2025
• MSCA Postdoctoral fellowships 10. 9. 2025
• ERC Proof of Concept 18. 9. 2025
• GAČR LA - Švýcarsko 8. 10. 2025
• MSCA Staff Exchanges 8. 10. 2025
• COST Actions 21. 10. 2025
• MSCA Doctoral Networks 25. 11. 2025
• GAČR LA – Rakousko, Německo průběžné, dva týdny před podáním na kontrola na Odd. projektové podpory

Výzvy, které budou vyhlášeny v nejbližší době + datum vyhlášení

• MSCA & Citizens 17. 6. 2025

Další výzvy a informace, viz portál zaměstnance, případně web Oddělení pro projektovou podporu.

Pro pomoc s přípravou neváhejte kontaktovat Marii Doležalovou (marie.dolezalova@sci.muni.cz).

• 4. 6. Hana Svozilová: DNA Recipes - What Defines People Around the World? (Medical Genomics, Šárka Pospíšilová group)
• 11. 6. special edition Sip of Science meets Sci Comms: Labs Coats off, Mics on! (students of the Science Communications course)

Přednáška o hyaluronanech

Česká imunologická společnost vás srdečně zve na přednášku doc. Lukáše Kubaly: "Beyond the Matrix: Hyaluronan as an Architect of Tissue Regeneration“. 

• KDY: 5. 6. od 13:00
• KDE: Přednáškový sál FGÚ AV ČR (Vídeňská 1083, Praha 4)/online
• ZOOM link: https://cesnet.zoom.us/j/91362597269

Obhajoby disertačních prací

čtvrtek! 12. 6. 2025, 10:00 hod, B11/306

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Fyziologie, imunologie a vývojová biologie živočichů

Mgr. Markéta Hrušková: Experimentální in vivo modely pro studium cirkulujících nádorových buněk během nádorové progrese

• Školitel: doc. Mgr. Karel Souček, Ph.D.
• Garant doc. Martin Vácha

čtvrtek! 12. 6. 2025, 11:45 hod, B11/306

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Fyziologie, imunologie a vývojová biologie živočichů

Mgr. Nikodém Zezula: Zebrafish model in the analysis of Wnt/PCP pathway and cancer

• Školitel: prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D.
• Garant: doc. Martin Vácha

20. 6. 2025, 13:00 hod, B11/205

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Molekulární a buněčná biologie a genetika

Mgr. Lucie Curylová: Proteiny rodiny p53 v regulaci kmenovosti u sarkomů dětského věku

• Školitel: doc. RNDr. Jan Škoda, Ph.D.
• Garant: prof. Petr Beneš

25. 6. 2025, 13:00 hod, B11/306

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Molekulární a buněčná biologie a genetika

Mgr. Oliver Šimončík: Regulace genové exprese během proteotoxického stresu

• Školitel: MUDr. Petr Muller, Ph.D.
• Garant: prof. Petr Beneš

27. 6. 2025, 10:00 hod, B11/306

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Molekulární a buněčná biologie a genetika

Mgr. Eva Chocholová: Zubní kámen jako zdroj poznatků o paleoekologii člověka – molekulárně biologická studie

• Školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.
• Garant: prof. Petr Beneš

27. 6. 2025, 12:00 hod, B11/306

Obhajoba doktorské disertační práce v programu Molekulární a buněčná biologie a genetika

Mgr. Hana Šimečková: Modification of Staphylococcal Bacteriophages for Application in Biosensing

• Školitelka: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
• Garant: prof. Petr Beneš

Seminář Analýza RNA – Od základů qPCR po RNA interferenci

Srdečně Vás zveme na seminář, který se zaměří na kompletní analýzu RNA od izolace až po qPCR a další aplikace. Seminář je přístupný všem zájemcům nezávisle na jejich zaměření či věku a je vhodný i pro vysokoškolské studenty. Registrovat se můžete buď na seminář do Prahy (11. 6.) nebo do Brna (12. 6.).

Co Vás čeká?

• Metody přípravy vzorku pro izolaci RNA
• Základy real-time PCR a různé možnosti detekce
• Zpracování a analýzu dat z qPCR včetně troubleshootingu nejčastějších problémů
• Základy RNA interference (RNAi)
• Cílené tlumení genů pomocí specifické poolované siRNA
• Metody odstranění rRNA při sekvenování RNA

Na závěr Vám budou představena inovativní praktická řešení pro úchovu vzorků RNA, která Vám umožní dlouhodobě skladovat Vaše drahocenné vzorky.

Srdečně gratulujeme oceněným z našeho ústavu: Mgr. Patrikovi Matušů (OFIŽ), dr. Karolíně Bořánkové (OGMB) a prof. Jiřímu Doškařovi (OGMB). Přijďte si užít slavnostní chvíle s nimi!

Seznam všech oceněných najdete na stránce zde.

Cena rektora za vynikající disertační práci

Jiří Holoubek, nedávný absolvent doktorského studia Mikrobiologie, získal při příležitosti Dies Academicus Cenu rektora za vynikající disertační práci. Ve svém výzkumu se zaměřil na virus klíšťové encefalitidy a další příbuzné flaviviry. Disertaci zpracovával na pracovišti virologie pod vedením prof. Daniela Růžka a doc. Luďka Eyera.

Jeho práce přinesla nejen několik vysoce impaktovaných publikací, ale především zásadní posun v našem chápání sekundárních struktur v rámci virové RNA, procesu zrání flavivirových částic a možností antivirové léčby. Gratulujeme!

Foto: Martin Indruch

Jaro = reportáže o klíšťatech

Co by to bylo za jaro bez reportáže o klíšťatech. I letos se široká veřejnost seznámila s problematikou klíšťat, jejich sběru a diagnostiky přenášených patogenů - například záchytu bakterie Borrelia miyamotoi, která způsobuje onemocnění podobné návratové horečce. V reportážích uslyšíte doc. Alenu Žákovskou a dr. Helenu Nejezchlebovou (OFIŽ). Namátkou se můžete podívat na reportáž v Událostech ČT z 27. dubna (čas 19:41) nebo si poslechnout reportáž v pořadu Dobré ráno, Moravo z 16. 5. (čas 8:21).

Vznikl nový doktorský program zaměřený na rostliny

Ve spolupráci s Národním centrem pro výzkum biomolekul (NCBR) vznikl nový meziústavní doktorský program Experimentální biologie rostlin! Jeho vznik iniciovali prof. Lysák, prof. Wimmerová a prof. Bryja, garantkou programu je doc. Petra Procházková Schrumpfová (NCBR).

Nový program má ambiciózní cíl vytvořit platformu pro výzkum a vzdělávání doktorských studentů z různých pracovišť zabývajících se experimentální biologií rostlin. Propojí špičkové výzkumníky s jejich studenty a studentkami v oblasti fyziologie, genomiky a proteomiky rostlin, strukturní biologie i bioinformatiky. Interdisciplinární studium je otevřeno studentům se zájmem o výzkum rostlin na úrovni genomu, fyziologie i biotechnologických aplikací.

Na vedení studentů se budou podílet školitelé z různých pracovišť včetně Oddělení experimentální biologie rostlin, CEITEC MU, Akademie věd ČR (např. Biofyzikální ústav, Ústav experimentální botaniky, CzechGlobe) a dalších českých vědeckých institucí. Propojení špičkového výzkumu a moderních technologií studentům nabízí možnost věnovat se tématům jako adaptace rostlin na klimatickou změnu či moderní biotechnologie.

Tým iGEM Brno přinesl na kampus studentskou párty ve stylu Silicon Valley!

Můžeš mít všechny zdroje světa — a stejně selžeš — pokud ti chybí ten správný mindset!

A protože porazit Cambridge a Oxford v největší biotechnologické soutěži na světě není zrovna jednoduché, rozhodli jsme se koncentrovat zlaté standardy na jedno místo a pozvali jsme: hackera (protože iGEM tým musí přijít s něčím opravdu inovativním), dva hustlery (protože my akademici se musíme naučit exekuovat dvakrát rychleji) a hipstera (protože naše úsilí musíme nakonec umět i prodat)!

Na večírku (Bio)hackers, hustlers and hipsters in Brno jsme měli my i naši hosté tu čest načerpat inspiraci od:

• Mitche Altmana, legendárního hackera a otce hackerspace hnutí ze San Francisca, který nám přiblížil, co to znamená být hackerem, a ukázal, že nestačí jen tvořit cool věci — důležité je také budovat komunitu.
• Jána Kaspera, jednoho z mála skutečných venture kapitalistů v CZ/SK prostoru ze ZAKA VC. Povídali jsme si s ním o tom, proč má smysl investovat náš čas, nebo něčí prostředky do inovací a startupů.
• Vojty Ročka, startupisty s úspěšným exitem, angel investora a spoluzakladatele České startupové asociace. Vojtova otázka „Proč náš stát každoročně spálí 44 miliard korun na grantech?“ rozproudila opravdu zajímavou debatu :)
• Petra Dendise, vizionářského hipstera a sériového podnikatele, který nám prozradil, jak menežuje štěstí a vybírá si ty správné lidi do týmu.

Obrovský dík patří hlavnímu partnerovi Tensor Ventures za důvěru, vinařství Vican, pražírnám Rebelbean a Fiftybeans za podporu a také CEITEC, NCBR a ÚEB za pomoc s organizací večírku!

Mindsety máme. Teď už jen ta těžší část – vyhrát iGEM.
Sledujte naši cestu do Paříže a za vítězstvím v iGEMu na: @igem_brno!

iGEM Brno je tým složený z 23 studentů převážně z PřF MUNI, z našeho ústavu to jsou Barbora Gavendová, Tereza Slančíková, Matúš Grieš, Miroslav Rosputinský a Matej Zámečník. Misí iGEM Brno je udělat rostliny skutečně škálovatelné a vyhrát iGEM, největší a nejprestižnější světovou soutěž v syntetické biologii. Bioinženýrské metody aplikují na nejrychleji rostoucí kvetoucí rostlinu světa, okřehek (duckweed). Kromě bioinženýrských aplikací přináší využití okřehku také ve formě salátu a proteinového prášku – okřehek totiž obsahuje kompletní spektrum aminokyselin, řadu vitamínů a minerálů.

Konference Metamorphosis pro popularizátory vědy

"Science is not finished until it’s communicated" Sir Mark Walport, UK Chief Scientist, 2013

Ve dnech 22. - 23. 5. jsme se účastnili prvního ročníku popularizační konference Metamorphosis. Akce nabízela přednášky, debaty a workshopy z oblasti poularizace vědy jak pro nadšené tvůrce obsahu, tak pro zástupce institucí, kteří v oblasti komunikaci vědy a PR pracují.

A střípky z konference pro vás?

• 👧 nejlepší školou komunikace vědy je vysvětlování vašich vědeckých otázek dětem. 
• 👨‍🔬 celosvětová důvěra ve vědu a vědce je vysoká, koukněte na data z TISP projektu.
• 📧 přibližovat vědu lidem mohou i introverti, zapojte se například do projektu Zeptej se vědce
• 🤹‍♂️Jste extrovertní a soutěživí? Pošlete své 3minutové vystoupení do soutěže FameLab. Letošní ročník ještě stihnete!

Workshop pro gymnazisty

V květnu uspořádalo Oddělení experimentální biologie rostlin workshop určený studentům Gymnázia Tišnov.

Během této akce si studenti mohli sami vyzkoušet přípravu roztlakových preparátů z kořenů cibule a pomocí mikroskopu pak pozorovali jednotlivé fáze mitózy. Dvouhodinový program nabídl studentům možnost aktivně se zapojit do jednoduchého biologického pokusu pod vedením odborníků.

Zvědaví školáci objevovali vědu

Doktorská obhajoba Kateřiny Kavanové

Dne 23. 5.2025 proběhla obhajoba disertační práce doktorandky MVDr. Kateřiny Kavanové. Ve své práci se věnovala komplexnímu mikrobiologickému zpracovávání vzorků z divokých prasat i prasat domácích s cílem nalézt mikrobiální kmeny s potenciální aplikací jako probiotika.

Gratulujeme k úspěšnému ukončení doktorského studia a přejeme hodně úspěchů v budoucím kariérním i osobním životě!

Nový grant na výzkum antivirotik proti viru krymsko-konžské hemoragické horečky (CCHFV)

Jiří Holoubek, postdoktorand působící ve virologické skupině na oddělení mikrobiologie, získal podporu z výzvy EDUC-WIDE Seed na projekt “Bridging Biosafety Levels: A Dual Antiviral Screening Platform to Combat Crimean-Congo Haemorrhagic Fever Virus”, jehož cílem je vytvoření duální screenovací platformy pro testování antivirotik proti viru CCHFV s využitím bezpečnějšího BSL-2 modelu – viru Hazara. Projekt propojuje expertízu obou institucí a kombinuje různé přístupy včetně inovativních AI nástrojů, drug-repurposingu (využití dosavadních léčiv k novým terapeutickým účelům) a práce na úrovni nejvyššího biologického zabezpečení.

Projekt byl podán za Masarykovu univerzitu a druhým klíčovým partnerem je BSL-4 laboratoř VNL na Univerzitě v Pécsi (Maďarsko), kde Jiří zároveň působí. Koneckonců - v březnovém newsletteru jste mohli číst o nácviku nečekaných situací právě v této laboratoři.

Návštěva profesora Demirera z USA

Dne 29. 4. navštívil oddělení mikrobiologie profesor Goksel Demirer z Central Michigan University. Diskutovali jsme o možnosti spolupráce v několika zajímavých oblastech, jako jsou Anaerobic Environmental Biotechnology, Wastewater Engineering, Cleaner Production/Pollution Prevention, Industrial Symbiosis, Bioenergy a Biobased Products.

Studenti LAM měli skvělou příležitost prezentovat výsledky svého výzkumu, diskutovat nad nimi a nad jejich aplikací. Bylo to inspirující setkání a těšíme se na budoucí společné projekty!

17. ročník Letní besídky zaměstnanců, studentů a přátel OFIŽ

Ukončení semestru je i letos vhodnou záminkou k tradiční venkovní párty a budování sociálních vazeb napříč generacemi i pracovišti. Věřte nebo ne – letos se sejdeme už po sedmnácté!

• KDY: čtvrtek 26. června 2025, postupně od 16:00
• KDE: v okolí budovy D36
• CO: zábava, dobročinná tombola, swap pokojovek, drinky, pivo včetně sponzorského piva Proud (díky!), víno, nealko + věci na gril/k zakousnutí/napití + co kdo donese
• ZA KOLIK: 150 Kč, splatné v D36/116 nebo na místě

Přijdete? Zapište se prosím do tabulky a pomozte nám tak odhadnout nákupy.

Doktorská obhajoba Ondřeje Vacka

Mgr. Ondřej Vacek v pátek 30. 5. obhájil svou disertační práci Porozumění úlohy Trop-2 v plasticitě a diseminaci nádorových buněk a stal se tak dalším doktorem vzešlým z našeho programu Fyziologie, imunologie a vývojová biologie živočichů. Své téma zpracoval pod vedením doc. Karla Součka na Biofyzikálním ústavu AV ČR.

Přejeme mnoho dalších úspěchů ve skvěle našlápnuté vědecké kariéře!

Nový bilaterální projekt Mikrofluidní inovace pro výzkum Alzheimerovy choroby

Společně s týmem mikrofluidiky na ETH v Zürichu jsme zahájili nový bilaterální výzkumný projekt, který kombinuje přední odborné znalosti v oblasti biofyziky proteinů, membránové biologie a mikrofluidní technologie.

Cílem projektu, který vedou Prof. Zbyněk Prokop (MUNI) a Dr. Stavros Stavrakis (ETH Zürich), je vyvinout mikrofluidní platformy nové generace pro formulaci a manipulaci s obřími unilamelárními vezikulami (GUV), pokročilými modely buněčných membrán. Tyto platformy budou použity ke studiu mechanismů Alzheimerovy choroby a urychlí hledání účinných léčebných postupů.

Mezi hlavní cíle patří:

• vysokokapacitní analýza chování membránových proteinů
• zkoumání mechanismů, které jsou důvodem membránové toxicity v patologii Alzheimerovy choroby
• skríning nových terapeutik za podmínek, které věrně napodobují fyziologické lipidové prostředí

Projekt je podporován Švýcarskou národní vědeckou nadací (SNSF, vedoucí agentura) a GA ČR.

Kurz Kinetics 2025 v Paříži

Prof. Zbyněk Prokop se podílel na realizaci kurzu Kinetics 2025 v Pasteurově institutu v Paříži. Zbyněk přednesl tři přednášky a dva tutoriály o analýze kinetických dat a metodách rychlého míchání.

Během kurzu si účastníci a přednášející vyměnili poznatky o biomolekulárních interakcích se zaměřením na porovnání technik analýzy na povrchu a v roztoku a nechyběly ani bohaté diskuse na toto téma. Účastníci kurzu si také vyzkoušeli vystavená inovativní zařízení určená k analýze biomolekulárních interakcí.